3階建てでも屋根の上にアンテナの設置は可能でしょうか？

作業可能です。
3階建ての場合は3階のベランダに梯子をかけ屋根に登ります。

ただし、急勾配の屋根の場合は屋根の上での作業が困難なため高所作業車が必要となります。
その場合は別途作業料金が必要です。